xsdからvbクラスを生成する際は自前で名前空間を指定しなければならない

xsd.exe (xsdファイル名) /classes /l:vb /n:(名前空間)

クラスファイルに、単純に namespace (名前空間) を追加するだけです。プロジェクトの名前空間からの相対的な名前空間を指定せずにフルの名前空間を指定すると失敗します。